Прямоугольное полотнище с соотношением ширины к длине 2:3, состоящее из двух горизонтальных полос: верхней зеленого цвета шириной 4/5 ширины полотнища и нижней желтого цвета; в центре зеленой полосы летящий к древку степной орел желтого цвета с клювом и лапами красного цвета, держащий в лапах дубовую ветвь желтого цвета.

Обоснование символики:
Флаг создан на основе герба района.
Куюргазинский район – южные ворота Республики. Своим названием район обязан реке Куюргаза, притоку реки Большая Юшатырь. В переводе с башкирского «Куюргаза» означает источник реки.
Когда-то в древние времена на территории района жили три башкирских рода – кипчаки, тамьяны и бурзянцы, славящиеся особой храбростью и выносливостью. Их потомки впоследствии прославили Куюргазинский район своим героизмом.
Всю богатую историю этой земли вместил в себя герб Куюргазинского района, который отражает природные, исторические и культурные особенности района.
Центральная фигура герба – взлетающий степной орел, который держит в когтях дубовую ветвь.
Издревле орел является одним из родовых атрибутов – птицей кипчаков, потомки которых составляют сегодня преимущественное население Куюргазинского района. Летящий золотой орел – символ справедливости, богатства, независимости, силы, великодушия, прозорливости, свидетельствует о связи времен, стремлении в будущее, преодолении препятствий, развитии района.
Дубовая ветвь символизирует прочность, надежность многонационального народа, населяющего край.
Семь золотых колосьев – это символ трудолюбия землепашцев, знак богатства края. Число колосьев – семь символизирует семь родов, положивших начало единению народов, проживающих на территории республики.
Зеленый цвет – символ плодородия земли, разнообразия растительного, животного мира, а также символ надежды, изобилия, свободы, покоя и мира.

Утвержден решением Совета муниципального района Куюргазинский район Республики Башкортостан (#1/10-92) от 13 июля 2006 года.