Прямоугольное полотнище с соотношением ширины к длине 2:3, состоящее из двух горизонтальных полос: верхней зеленого цвета шириной 2/3 ширины полотнища и нижней синего цвета; в центре зеленой полосы идущий к древку лось белого цвета.

Обоснование символики:
Флаг создан на основе герба района.
Основной фигурой герба является серебряный лось – в знак обитания данных животных в крае, которые являются самыми крупными представителями живой природы района. В гербе лось символизирует свободу, достоинство, готовность идти вперед, преодолевать трудности и препятствия.
Серебряный цвет – это символ благородства, веры, чистоты, искренности, откровенности, особенно присущим жителям края.
На территории района расположен государственный заказник, где произрастает 42 редких дикорастущих лекарственных растения и обитает более 17 видов насекомых, птиц и зверей, внесенных в Красную Книгу. О природном богатстве района говорит основной поля герба зеленый – символ изобилия, плодородия, радости, свободы, покоя и мира.
Три родовые тамги юрматинских башкир: тальтим, татигас, кармыш символизируют, что территория района являлась вотчинными землями этого рода, потомки которых вместе с многонациональным народом живут и трудятся здесь и ныне.
В оконечности лазоревого цвета три серебряные рыбы в знак богатства района водой и рыбой.
Лазоревый цвет символизирует красоту, верность, доверие, безупречность, развитие, движение вперед, означает реки Ашкадар, Дема, Салмыш, берущих начало в районе.

Утвержден решением Совета муниципального района Федоровский район Республики Башкортостан (#9 (114)) от 17 июля 2006 года.