Прямоугольное синее полотнище с соотношением ширины к длине 2:3, в центре которого летящий к древку голубь белого цвета, держащий в клюве желтого цвета оливковую ветвь желтого цвета с листьями зеленого цвета.

Обоснование символики
Флаг создан на основе герба города.
История города Благовещенска связана с основанием и строительством в 1756 году медеплавильной фабрики. В этом же году в день христианского праздника Благовещения была заложена одноименная церковь, что и определило впоследствии название поселка, позднее ставшего городом Благовещенском.
Эти исторические события легли в основу создания герба.
Центральным элементом герба является голубь, держащий в золотом клюве оливковую ветвь с зелеными листьями – символ благой вести, мира и процветания.
Лазоревый цвет повторяет синий цвет Государственного флага Республики Башкортостан и выбран в качестве цвета поля герба в знак территориальной принадлежности к республике, символизирует ясность, добродетель и чистоту помыслов.
Кроме того, и центральный элемент герба города – голубь, и лазоревый цвет поля герба повторяют мотивы герба Благовещенского района, на территории которого расположен город Благовещенск.
Серебро символизирует благую весть дня Благовещения, рождение нового, чистого и благородного.
Золото – это символ богатства, ценности, прочности и процветания.

Утвержден решением Совета городского поселения город Благовещенск Республики Башкортостан (#79) от 8 сентября 2006 года.